El conjunto formado por el Pantano de Elche posee una gran diversidad botánica formada hasta el momento por más de 350 especies de plantas, 15 de hongos, 17 de líquenes, 5 musgos y 4 de algas. Esta importante variedad de taxones surge a consecuencia de la gran heterogeneidad de ambientes que representan el paisaje del Pantano de Elche, fruto de una climatología marcada por la escasez hídrica y las altas temperaturas medias anuales, una topografía diversa donde se intercalan montes, con llanos y cursos regulares e intermitentes de agua y una gran variedad de suelos, todo ello sin olvidar un factor de gran importancia paisajística, la influencia del ser humano.
La flora del Pantano de Elche constituye el conjunto de especies vegetales que ocupan tanto el área comprendida a la cuenca del propio embalse como a todas aquellas presentes en las sierras, colinas, montes y llanuras aledañas al Pantano. Estas especies tienen un papel crucial en el ecosistema, siendo las encargadas de transformar la energía del sol en materia orgánica y ponerla a disposición del resto de los organismos no fotosintéticos para su nutrición y ser las productoras de oxígeno necesario para el resto de los organismos aerobios.